Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FZD4Q9ULV1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms