Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIMKLBQ9ULI2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIMKLBQ9ULI2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIMKLBQ9ULI2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIMKLBQ9ULI2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIMKLBQ9ULI2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIMKLBQ9ULI2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIMKLBQ9ULI2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIMKLBQ9ULI2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIMKLBQ9ULI2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIMKLBQ9ULI2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIMKLBQ9ULI2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIMKLBQ9ULI2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RIMKLBQ9ULI2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIMKLBQ9ULI2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIMKLBQ9ULI2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RIMKLBQ9ULI2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIMKLBQ9ULI2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIMKLBQ9ULI2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms