Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLCO3A1Q9UIG8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLCO3A1Q9UIG8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLCO3A1Q9UIG8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLCO3A1Q9UIG8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLCO3A1Q9UIG8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLCO3A1Q9UIG8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLCO3A1Q9UIG8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLCO3A1Q9UIG8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLCO3A1Q9UIG8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLCO3A1Q9UIG8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLCO3A1Q9UIG8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLCO3A1Q9UIG8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLCO3A1Q9UIG8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms