Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms