Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms