Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCDH10Q9P2E7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms