Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms