Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms