Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms