Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB4Q9NTQ9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms