Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLE3Q9NRF9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLE3Q9NRF9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLE3Q9NRF9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLE3Q9NRF9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLE3Q9NRF9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLE3Q9NRF9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLE3Q9NRF9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLE3Q9NRF9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
POLE3Q9NRF9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
POLE3Q9NRF9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
POLE3Q9NRF9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLE3Q9NRF9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLE3Q9NRF9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLE3Q9NRF9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLE3Q9NRF9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLE3Q9NRF9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLE3Q9NRF9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLE3Q9NRF9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLE3Q9NRF9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLE3Q9NRF9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLE3Q9NRF9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
POLE3Q9NRF9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLE3Q9NRF9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLE3Q9NRF9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
POLE3Q9NRF9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLE3Q9NRF9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
POLE3Q9NRF9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLE3Q9NRF9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLE3Q9NRF9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLE3Q9NRF9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLE3Q9NRF9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLE3Q9NRF9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLE3Q9NRF9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLE3Q9NRF9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLE3Q9NRF9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLE3Q9NRF9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms