Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CD163L1Q9NR16 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CD163L1Q9NR16 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CD163L1Q9NR16 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CD163L1Q9NR16 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CD163L1Q9NR16 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CD163L1Q9NR16 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CD163L1Q9NR16 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CD163L1Q9NR16 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CD163L1Q9NR16 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CD163L1Q9NR16 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CD163L1Q9NR16 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CD163L1Q9NR16 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CD163L1Q9NR16 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CD163L1Q9NR16 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CD163L1Q9NR16 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms