Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms