Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms