Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW27

NUP85, Nuclear pore complex protein Nup85, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP85Q9BW27 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP85Q9BW27 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP85Q9BW27 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP85Q9BW27 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP85Q9BW27 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP85Q9BW27 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP85Q9BW27 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP85Q9BW27 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP85Q9BW27 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP85Q9BW27 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP85Q9BW27 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP85Q9BW27 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP85Q9BW27 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP85Q9BW27 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP85Q9BW27 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP85Q9BW27 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP85Q9BW27 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP85Q9BW27 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms