Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms