Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF559Q9BR84 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms