Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms