Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms