Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms