Protein–RNA interactions for Protein: Q96PL1

SCGB3A2, Secretoglobin family 3A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB3A2Q96PL1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms