Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCLT1Q96NL6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms