Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF4Q96M43 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF4Q96M43 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms