Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms