Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS3Q969F9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms