Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TAF4BQ92750 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF4BQ92750 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF4BQ92750 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF4BQ92750 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF4BQ92750 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF4BQ92750 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF4BQ92750 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF4BQ92750 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF4BQ92750 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF4BQ92750 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF4BQ92750 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF4BQ92750 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF4BQ92750 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF4BQ92750 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF4BQ92750 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF4BQ92750 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF4BQ92750 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF4BQ92750 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF4BQ92750 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms