Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NCSTNQ92542 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCSTNQ92542 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NCSTNQ92542 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCSTNQ92542 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCSTNQ92542 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCSTNQ92542 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCSTNQ92542 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCSTNQ92542 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCSTNQ92542 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCSTNQ92542 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCSTNQ92542 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCSTNQ92542 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCSTNQ92542 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCSTNQ92542 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NCSTNQ92542 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NCSTNQ92542 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NCSTNQ92542 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCSTNQ92542 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCSTNQ92542 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NCSTNQ92542 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCSTNQ92542 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCSTNQ92542 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCSTNQ92542 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCSTNQ92542 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCSTNQ92542 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCSTNQ92542 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCSTNQ92542 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCSTNQ92542 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCSTNQ92542 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
NCSTNQ92542 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCSTNQ92542 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCSTNQ92542 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NCSTNQ92542 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCSTNQ92542 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCSTNQ92542 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCSTNQ92542 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NCSTNQ92542 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCSTNQ92542 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCSTNQ92542 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NCSTNQ92542 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NCSTNQ92542 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCSTNQ92542 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCSTNQ92542 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCSTNQ92542 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NCSTNQ92542 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCSTNQ92542 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NCSTNQ92542 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCSTNQ92542 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
NCSTNQ92542 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCSTNQ92542 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCSTNQ92542 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCSTNQ92542 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCSTNQ92542 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCSTNQ92542 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCSTNQ92542 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCSTNQ92542 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCSTNQ92542 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NCSTNQ92542 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCSTNQ92542 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NCSTNQ92542 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NCSTNQ92542 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCSTNQ92542 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NCSTNQ92542 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NCSTNQ92542 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NCSTNQ92542 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NCSTNQ92542 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NCSTNQ92542 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCSTNQ92542 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NCSTNQ92542 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NCSTNQ92542 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NCSTNQ92542 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NCSTNQ92542 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NCSTNQ92542 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NCSTNQ92542 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCSTNQ92542 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NCSTNQ92542 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCSTNQ92542 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NCSTNQ92542 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCSTNQ92542 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCSTNQ92542 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms