Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWK9

CKAP2, Cytoskeleton-associated protein 2, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2Q8WWK9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP2Q8WWK9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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