Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND24

RNF214, RING finger protein 214, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF214Q8ND24 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF214Q8ND24 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms