Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RHOT1Q8IXI2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms