Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
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