Protein–RNA interactions for Protein: Q86YI8

PHF13, PHD finger protein 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF13Q86YI8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms