Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTF1AQ7RTS3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms