Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms