Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSY5

PPP1R3F, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3FQ6ZSY5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R3FQ6ZSY5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms