Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms