Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPTNQ6XPR3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms