Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
VIRMAQ69YN4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms