Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms