Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 KLK13-207ENST00000596955 737 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CHIC1Q5VXU3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC36.76■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms