Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CCDC18Q5T9S5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms