Protein–RNA interactions for Protein: Q5JR12

PPM1J, Protein phosphatase 1J, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1JQ5JR12 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPM1JQ5JR12 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms