Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ODF2Q5BJF6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms