Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
C4orf17Q53FE4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms