Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP100Q494V2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP100Q494V2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
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