Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms