Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms