Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LONRF1Q17RB8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
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LONRF1Q17RB8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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LONRF1Q17RB8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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