Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDO1Q16878 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
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