Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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